本會成立於民國37年5月10日，由台灣藥界蓍老　謝清雲及藍石興、黃獅等藥師前輩，攜手創立，共推謝清雲為首屆理事長，當時會員十指可屈，會務會址，居無定所。其間又遭逢兩次水患，公文書簡片甲不存，故更難以尋覓先賢步過足跡。民國69年12月31日才依藥師法規定更名為「基隆市藥師公會」，後於95年6月20日申請法人登記為「社團法人基隆市藥師公會」，同年在王前理事治明的奔走下完成會館落成，公會告別一甲子的漂泊，並在上任巫前理事長宗麟的代領下，公會往ｅ化前進，為會員做更好的服務。現任曾理事長更積極成立本市專屬照護團隊，提供本市市民優質服務。